Als Pianist pflegt Moritz Ernst ein großes Repertoire von den Meistern der Wiener Klassik (besonders J. Haydn, und L.v.Beethoven) über die Romantiker - u.a. Brahms (z. B. Sonate Op.1) und Reger - hin zu einer breiten Auswahl an Werken der Moderne: Stockhausen (Klavierstück X), Eötvös (KOSMOS), Messiaen (Oiseaux exotiques) , der Wiener Schule (Schönberg, Webern), der sog. verfemten Musik (gesamtes Klavierwerk V. Ullmanns sowie der überlieferten Sonaten Norbert von Hannenheims) und dem Futurismus: G. Antheil, A. Lourié...
Dazu kommt die Zusammenarbeit mit vielen zeitgenössischen Komponisten, wie Miklos Maros, Kent Olofsson, Peter Köszeghy, Bernfried Pröve, Michael Pelzel, Hans Ulrich Lehmann, u.a.

Als Cembalist hat Moritz Ernst ein Repertoire mit Werken von J. S., C. P. E. Bach, Händel und dem Fitzwilliam Virginal Book, sowie moderner Cembalomusik der Komponisten Henze, Ligeti, Poulenc, Martinu, Milhaud, Maros, Lehmann und anderen. 

Das klassische Repertoir, eine Auswahl
Fitzwilliam Virginal Book (Auswahl, Werke von Orlando Gibbons, William Byrd, John Bull, John Munday...)
Johann Sebastian Bach: Französische Suiten, Klavierübung III (4 Duette), Klavierübung IV (Goldbergvariationen)
Béla Bartok: Im Freien, Sonatine
Muzio Clementi: Sonate op.26/2
Claude Debussy: Préludes I, Études (Auswahl)
Georg Friedrich Händel: Chaconne G-Dur, Suite HWV 427
Joseph Haydn: Capriccio "Acht Sauschneider müssen sein" Hob.: XVII:1, Fantasia C-Dur Hob.: XVII:4, Sonaten Hob.: XVI: 34 e-Moll; Hob.: XVI:37 D-Dur; ; Hob.: XVI: 59 Es-Dur
Ludwig van Beethoven: Sonaten op.2/1, op.26, op.28, op.109, op.110 Variationen op.34, Variationen op.105 + op.107, Fantasie op.77, Polonaise op.89
Lili Boulanger: Variations
Johannes Brahms: Sonate op.1, Intermezzi op.117, Variationen aus op.18
Ferrucio Busoni: Fantasia contrappuntistica, Sonatina seconda, Bach/Busoni: Toccata, Adagio & Fuge C-Dur
Franz Liszt: Präludium und Fuge über BACH, Cantico di San Francesco
Wolfgang Amadeus Mozart: Sonaten KV 331, KV 332, KV 545 , Fantasie KV 397
Jean Philippe Rameau: Piece de clavecin (u.a. Sarabande, Gavotte varié, Les Trois Mains, La Poule, L'entretien des muses) 
Max Reger: Humoresken
Samuel Scheidt: Fuga III, Cantio belgica "Wehe, Windgen, wehe" (Tabulatura Nova)
Arnold Schönberg: Klavierstücke op.11 und op.19
Franz Schubert: Sonaten D.537, D.664
Alexander Skrjiabin: 10.Sonate
Igor Strawinsky: Trois mouvements de Pétrouchka
Viktor Ullmann: Variationen op3a, Sonaten I - VII (= gesamtes Klavierwerk)
Anton Webern: Variationen op.27

Neue Musik, Klavier solo, Auswahl
Claude Loyola Allgén: Fran cis till ces
William Alwyn: Fantasy Waltzes
George Antheil: Sonate sauvage, Little shimmy, Toccata No.2, Fireworks and profane Waltz
Hans Erich Apostel: Kubiniana op.13, Sonate op.2
Sir Malcolm Arnold: Das gesamte Klavierwerk
Sandeep Bhagwati: Floating Feelings, Tenerenmente
Jimmie LeBlanc: "...stop being a glass, be a lake"
Minas Borboudakis: Palindromia
Walter Boudreau: Les planètes
Pierre Boulez: 12 Notations
Walter Braunfels: Lyrischer Kreis, Präludien
John Cage: 34 for a pianist
Edison Denissow: Bagatellen
Moritz Eggert: Kreislerianana
Mike Edgerton: Sonata No.1
Peter Eötvös: KOSMOS
Beat Furrer: phasma
Norbert von Hannenheim: Die überlieferten Sonaten (2, 3, 4a/b, 6, 12)
Anna Höstman: Allemain
Gabriel Iranyi: Bird in space
Max Käck: 3 postmusikalische Etüden
Ernst Lothar von Knorr: Nächtliche Suite, Kammersonate, Kleine Sonate in D
Alfred Knüsel: zerfließendes....FESTGEHALTEN
Peter Koeszeghy: NOIRE (noble-brilliante), Äther
Arthur Lourié: L'Emploi du temps, Unser Marsch, Petite Suite en fa, Masques, Formes dans l'air, Upman/Smoking Sketch, Der Fehler der Frau Tod...: Gesamtes Klavierwerk
Miklos Maros: Sonate, Rush, Kilskrift, Variazioni, Ernst und Spaß
Olivier Messiaen: Préludes, Études de rhythme, Vingts regards (Auswahl)
Kent Olofsson: Flings
Michael Pelzel: Brushing
Bernfried Pröve: Atharaxie II, Sonate Nr.2
Karel Reiner: Sonate Nr. 2
Wolfgang Rihm: Klavierstück IV, Nachstudie
Edward Staempfli: 6 Klavierstücke, Cinq Préludes (1976)
Karlheinz Stockhausen: Klavierstück X
Hans-Josef Winkler: Toccata in Schwarz und Weiß, 7 Fühl-Stücke in memoriam A.Bruckner
René Wohlhauser: Nesut, 3 Klavierstücke, Mania, Vocis imago (=complete piano works)
Alfred Zimmerlin: Klavierstück IV


1/16ton Klavier
Franz Jochen Herfert: EMS
Ernst Helmuth Flammer: Klavierstück 8
Simon Martin: Musique
Bruce Mather: Étude VII A, Hommage a Carrillo
Miklos Maros: Ernst und Spaß
Bernfried Pröve: SPALT, Hoammge a Gèrard
René Wohlhauser: Nesut


Neue Musik, Cembalo solo, Auswahl

Helmut Bieler: Kontraste
Minas Borboudakis: Hommage a Picasso
Henry Cowell: Set of Four
Violeta Dinescu: Prélude
Jean Francaix: Insectarium
Hans Werner Henze: Six absences, 3 Fragmente
Bruno Karrer: Ordre et desordre
Hans Ulrich Lehmann: Twi-is-light bird
Gyögy Ligeti: Continuum, Hungarian Rock
Miklos Maros: Bogen
Rudolf Moser: Spielmusik
Kent Olofsson: Isadora sings für Cembalo und Tonband, Treccia XI
Leonardo Polato: Constellations
Herman Schröder: Sonatina da camera